Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD42Q8N9B4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms