Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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