Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLIP4Q8N3C7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLIP4Q8N3C7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLIP4Q8N3C7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP4Q8N3C7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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