Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC117Q8IWD4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC117Q8IWD4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms