Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms