Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME9Q86XW9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms