Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU1Q7Z7A3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms