Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms