Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms