Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q71RC1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q71RC1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q71RC1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q71RC1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q71RC1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q71RC1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms