Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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