Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP31Q70CQ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms