Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP12Q6UXS9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms