Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms