Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms