Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms