Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms