Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms