Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms