Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms