Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms