Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATRNL1Q5VV63 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRNL1Q5VV63 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms