Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH4AQ5TD94 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms