Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF3Q5SZQ8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms