Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms