Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms