Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q56UQ5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q56UQ5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms