Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms