Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms