Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TBRG1Q3YBR2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TBRG1Q3YBR2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms