Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms