Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms