Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP21-3Q3LHN1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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KRTAP21-3Q3LHN1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
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KRTAP21-3Q3LHN1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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KRTAP21-3Q3LHN1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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KRTAP21-3Q3LHN1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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KRTAP21-3Q3LHN1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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