Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms