Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms