Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC27Q2M243 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms