Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HADHQ16836 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HADHQ16836 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HADHQ16836 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HADHQ16836 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms