Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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