Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FXNQ16595 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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FXNQ16595 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FXNQ16595 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FXNQ16595 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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