Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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