Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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