Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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