Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF1CQ15572 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1CQ15572 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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