Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3CQ15386 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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