Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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