Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCM1Q15154 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PCM1Q15154 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PCM1Q15154 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PCM1Q15154 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PCM1Q15154 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PCM1Q15154 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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PCM1Q15154 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PCM1Q15154 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCM1Q15154 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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