Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms