Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1D2Q14995 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms