Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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