Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN1Q14457 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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